Биологи создали несколько коротких цепочек нуклеотидов, способных изменять структуру одного из наиболее стабильных участков в РНК коронавируса и препятствовать копированию его генома, сообщает МФТИ.
Эти молекулы представляют собой короткие последовательности, состоящие из молекул замкнутых нуклеиновых кислот, близких к «буквам» РНК и ДНК, но модифицированных для достижения повышенной стабильности. Цепочки из замкнутых нуклеиновых кислот, которые способны блокировать «чтение» определенных генов, рассматриваются как потенциальная основа для разработки препаратов от рака.
Исследователи задались вопросом, можно ли применить эти цепочки из замкнутых нуклеиновых кислот для нарушения работы конкретного участка генома коронавируса. Этот участок ответственен за сборку двух цепочек аминокислот, pp1a и pp1ab, играющих важную роль в процессе формирования новых вирусных частиц. Этот регион в РНК коронавируса образует особую петлю, известную биологами как «псевдоузел».
Наличие «псевдоузла» заставляет рибосомы, клеточные белковые сборочные машины, переключаться между программами сборки pp1a и pp1ab. Ученые исследовали возможность блокировки этой петли для нарушения процесса синтеза соответствующих вирусных белков. В ходе решения этой задачи они анализировали структуру «псевдоузла» и выявили его уязвимое место, которое можно было заблокировать с использованием короткой цепочки нуклеотидов, содержащей замкнутые нуклеиновые кислоты или их аналоги.
В результате этих исследований были созданы молекулы, активно препятствующие взаимодействию между «псевдоузлом» и рибосомами, что существенно замедляло размножение SARS-CoV-2 в двух типах человеческих клеточных культур. Это открывает перспективу использования подобных цепочек нуклеотидов в качестве основы для разработки универсальных препаратов от коронавируса, сохраняющих эффективность на протяжении длительного времени, заключили ученые.
Фото: Prasesh Shiwakoti (Lomash) / Unsplash.com
